21世纪是生命科学的世纪，随着人类基因组计划的完成，人类蛋白组研究成为了生命科学乃至自然科学领域下一步的重大科学命题。在这一背景下，2004年6月30日，由军事医学科学院院长贺福初院士牵头，军事医学科学院、中国科学院、中国医学科学院、清华大学、北京大学、北京生物技术和新医药产业促进中心及江中集团共同发起，组建成立BPRC，并于2005年10月29日正式入驻中关村生命科学园。
据了解，BPRC专注于具有自主知识产权的蛋白质组和功能基因组的研究与开发，经过5年的建设，已经成为国际人类肝脏蛋白质组计划执行总部、蛋白质组学国家重点实验室、全军蛋白质组学重点实验室、蛋白质组学北京市重点实验室、“首都科技条件平台”和“中关村开放实验室”。另外，申报的蛋白质药物国家工程研究中心、国家蛋白质科学基础设施也已获得国家发改委批准，即将启动建设。BPRC建成“产、学、研、用”四维一体的综合基地的目标正在逐步实现中。
